Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF248Q8NDW4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF248Q8NDW4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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