Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RDH13Q8NBN7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RDH13Q8NBN7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RDH13Q8NBN7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RDH13Q8NBN7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RDH13Q8NBN7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RDH13Q8NBN7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RDH13Q8NBN7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RDH13Q8NBN7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RDH13Q8NBN7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RDH13Q8NBN7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RDH13Q8NBN7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RDH13Q8NBN7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RDH13Q8NBN7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RDH13Q8NBN7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RDH13Q8NBN7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RDH13Q8NBN7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RDH13Q8NBN7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RDH13Q8NBN7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RDH13Q8NBN7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RDH13Q8NBN7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RDH13Q8NBN7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RDH13Q8NBN7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RDH13Q8NBN7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RDH13Q8NBN7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RDH13Q8NBN7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
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