Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP38Q8NB14 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP38Q8NB14 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP38Q8NB14 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms