Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNBD1Q8NA66 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNBD1Q8NA66 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CNBD1Q8NA66 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CNBD1Q8NA66 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms