Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9U0

TC2N, Tandem C2 domains nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TC2NQ8N9U0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TC2NQ8N9U0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms