Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC24Q8N4L8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC24Q8N4L8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC24Q8N4L8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms