Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT5

PDZD3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD3Q86UT5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZD3Q86UT5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZD3Q86UT5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms