Protein–RNA interactions for Protein: Q86UB9

TMEM135, Transmembrane protein 135, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM135Q86UB9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM135Q86UB9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM135Q86UB9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM135Q86UB9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM135Q86UB9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms