Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMC4Q7Z404 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMC4Q7Z404 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMC4Q7Z404 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMC4Q7Z404 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMC4Q7Z404 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMC4Q7Z404 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMC4Q7Z404 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMC4Q7Z404 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMC4Q7Z404 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMC4Q7Z404 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMC4Q7Z404 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMC4Q7Z404 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMC4Q7Z404 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMC4Q7Z404 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMC4Q7Z404 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMC4Q7Z404 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMC4Q7Z404 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms