Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHST3Q7LGC8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHST3Q7LGC8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHST3Q7LGC8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHST3Q7LGC8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHST3Q7LGC8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHST3Q7LGC8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHST3Q7LGC8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHST3Q7LGC8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CHST3Q7LGC8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms