Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS12Q6ZW61 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BBS12Q6ZW61 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms