Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CXCL17Q6UXB2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCL17Q6UXB2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms