Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC171Q6TFL3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC171Q6TFL3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms