Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKC3

TXNDC11, Thioredoxin domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC11Q6PKC3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNDC11Q6PKC3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TXNDC11Q6PKC3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TXNDC11Q6PKC3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TXNDC11Q6PKC3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TXNDC11Q6PKC3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TXNDC11Q6PKC3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TXNDC11Q6PKC3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TXNDC11Q6PKC3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TXNDC11Q6PKC3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TXNDC11Q6PKC3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TXNDC11Q6PKC3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TXNDC11Q6PKC3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TXNDC11Q6PKC3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TXNDC11Q6PKC3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TXNDC11Q6PKC3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TXNDC11Q6PKC3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TXNDC11Q6PKC3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TXNDC11Q6PKC3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TXNDC11Q6PKC3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TXNDC11Q6PKC3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TXNDC11Q6PKC3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TXNDC11Q6PKC3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TXNDC11Q6PKC3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TXNDC11Q6PKC3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TXNDC11Q6PKC3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TXNDC11Q6PKC3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms