Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASC4Q6P4E1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASC4Q6P4E1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASC4Q6P4E1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.8 ms