Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q6P435 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q6P435 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q6P435 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q6P435 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q6P435 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q6P435 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q6P435 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q6P435 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Q6P435 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q6P435 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q6P435 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q6P435 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q6P435 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q6P435 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q6P435 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q6P435 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q6P435 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q6P435 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q6P435 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q6P435 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q6P435 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q6P435 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Q6P435 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q6P435 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q6P435 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q6P435 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Q6P435 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Q6P435 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q6P435 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q6P435 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q6P435 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q6P435 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q6P435 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q6P435 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q6P435 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q6P435 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q6P435 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q6P435 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q6P435 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q6P435 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q6P435 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q6P435 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q6P435 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q6P435 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q6P435 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q6P435 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q6P435 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Q6P435 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q6P435 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q6P435 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Q6P435 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q6P435 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q6P435 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q6P435 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q6P435 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q6P435 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q6P435 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q6P435 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q6P435 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Q6P435 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Q6P435 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Q6P435 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Q6P435 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q6P435 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q6P435 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q6P435 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Q6P435 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q6P435 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q6P435 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q6P435 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q6P435 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q6P435 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q6P435 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q6P435 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q6P435 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q6P435 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q6P435 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q6P435 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q6P435 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q6P435 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q6P435 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q6P435 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Q6P435 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q6P435 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q6P435 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q6P435 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q6P435 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q6P435 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q6P435 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q6P435 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q6P435 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q6P435 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q6P435 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q6P435 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q6P435 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q6P435 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q6P435 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q6P435 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q6P435 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms