Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1K8

GTF2H2C, General transcription factor IIH subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2CQ6P1K8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2H2CQ6P1K8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms