Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NANOGP8Q6NSW7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NANOGP8Q6NSW7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms