Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUMO4Q6EEV6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO4Q6EEV6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms