Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0B8

TIGD3, Tigger transposable element-derived protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD3Q6B0B8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIGD3Q6B0B8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIGD3Q6B0B8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms