Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP9Q5VTM2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP9Q5VTM2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms