Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRAMEF5Q5TYX0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRAMEF5Q5TYX0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRAMEF5Q5TYX0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRAMEF5Q5TYX0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRAMEF5Q5TYX0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRAMEF5Q5TYX0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRAMEF5Q5TYX0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PRAMEF5Q5TYX0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRAMEF5Q5TYX0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRAMEF5Q5TYX0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRAMEF5Q5TYX0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF5Q5TYX0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF5Q5TYX0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF5Q5TYX0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF5Q5TYX0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF5Q5TYX0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF5Q5TYX0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF5Q5TYX0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF5Q5TYX0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF5Q5TYX0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF5Q5TYX0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRAMEF5Q5TYX0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRAMEF5Q5TYX0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRAMEF5Q5TYX0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRAMEF5Q5TYX0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRAMEF5Q5TYX0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms