Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD12Q587J7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms