Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FNDC1Q4ZHG4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms