Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP13A4Q4VNC1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP13A4Q4VNC1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.3 ms