Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TPRNQ4KMQ1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TPRNQ4KMQ1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TPRNQ4KMQ1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
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