Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0N8

SLC9C1, Sodium/hydrogen exchanger 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C1Q4G0N8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC9C1Q4G0N8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC9C1Q4G0N8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC9C1Q4G0N8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC9C1Q4G0N8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC9C1Q4G0N8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC9C1Q4G0N8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC9C1Q4G0N8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC9C1Q4G0N8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC9C1Q4G0N8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC9C1Q4G0N8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC9C1Q4G0N8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC9C1Q4G0N8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC9C1Q4G0N8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC9C1Q4G0N8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC9C1Q4G0N8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC9C1Q4G0N8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms