Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LINC00303Q3SY05 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00303Q3SY05 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms