Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-BQ31612 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms