Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAQ29983 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAQ29983 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAQ29983 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAQ29983 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAQ29983 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAQ29983 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAQ29983 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAQ29983 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAQ29983 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MICAQ29983 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MICAQ29983 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MICAQ29983 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MICAQ29983 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MICAQ29983 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MICAQ29983 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MICAQ29983 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MICAQ29983 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MICAQ29983 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MICAQ29983 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAQ29983 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAQ29983 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAQ29983 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAQ29983 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAQ29983 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAQ29983 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAQ29983 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAQ29983 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAQ29983 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MICAQ29983 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MICAQ29983 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MICAQ29983 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MICAQ29983 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MICAQ29983 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MICAQ29983 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MICAQ29983 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MICAQ29983 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MICAQ29983 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MICAQ29983 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MICAQ29983 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MICAQ29983 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MICAQ29983 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MICAQ29983 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MICAQ29983 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MICAQ29983 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MICAQ29983 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MICAQ29983 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MICAQ29983 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MICAQ29983 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MICAQ29983 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MICAQ29983 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MICAQ29983 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MICAQ29983 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MICAQ29983 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MICAQ29983 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MICAQ29983 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MICAQ29983 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MICAQ29983 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MICAQ29983 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MICAQ29983 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MICAQ29983 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MICAQ29983 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MICAQ29983 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MICAQ29983 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MICAQ29983 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MICAQ29983 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MICAQ29983 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MICAQ29983 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MICAQ29983 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MICAQ29983 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MICAQ29983 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MICAQ29983 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MICAQ29983 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MICAQ29983 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MICAQ29983 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MICAQ29983 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MICAQ29983 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MICAQ29983 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MICAQ29983 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MICAQ29983 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MICAQ29983 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MICAQ29983 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MICAQ29983 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MICAQ29983 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MICAQ29983 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MICAQ29983 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MICAQ29983 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MICAQ29983 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MICAQ29983 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MICAQ29983 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
MICAQ29983 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MICAQ29983 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
MICAQ29983 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MICAQ29983 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MICAQ29983 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MICAQ29983 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MICAQ29983 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MICAQ29983 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MICAQ29983 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms