Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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NRF1Q16656 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
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NRF1Q16656 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRF1Q16656 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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NRF1Q16656 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
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NRF1Q16656 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRF1Q16656 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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