Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USF2Q15853 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USF2Q15853 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USF2Q15853 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USF2Q15853 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USF2Q15853 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USF2Q15853 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USF2Q15853 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USF2Q15853 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USF2Q15853 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USF2Q15853 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USF2Q15853 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USF2Q15853 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USF2Q15853 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USF2Q15853 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USF2Q15853 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USF2Q15853 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USF2Q15853 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USF2Q15853 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USF2Q15853 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USF2Q15853 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USF2Q15853 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USF2Q15853 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USF2Q15853 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USF2Q15853 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USF2Q15853 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USF2Q15853 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USF2Q15853 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USF2Q15853 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USF2Q15853 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USF2Q15853 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USF2Q15853 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USF2Q15853 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USF2Q15853 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USF2Q15853 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USF2Q15853 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USF2Q15853 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USF2Q15853 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USF2Q15853 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USF2Q15853 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USF2Q15853 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USF2Q15853 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USF2Q15853 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USF2Q15853 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USF2Q15853 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USF2Q15853 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USF2Q15853 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USF2Q15853 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USF2Q15853 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USF2Q15853 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USF2Q15853 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USF2Q15853 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USF2Q15853 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USF2Q15853 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USF2Q15853 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USF2Q15853 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USF2Q15853 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USF2Q15853 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USF2Q15853 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USF2Q15853 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USF2Q15853 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USF2Q15853 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USF2Q15853 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USF2Q15853 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USF2Q15853 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USF2Q15853 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USF2Q15853 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USF2Q15853 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USF2Q15853 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USF2Q15853 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USF2Q15853 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USF2Q15853 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USF2Q15853 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USF2Q15853 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USF2Q15853 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USF2Q15853 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USF2Q15853 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USF2Q15853 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USF2Q15853 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USF2Q15853 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USF2Q15853 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USF2Q15853 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USF2Q15853 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USF2Q15853 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USF2Q15853 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USF2Q15853 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USF2Q15853 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USF2Q15853 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USF2Q15853 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USF2Q15853 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USF2Q15853 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USF2Q15853 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USF2Q15853 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USF2Q15853 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USF2Q15853 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USF2Q15853 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USF2Q15853 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USF2Q15853 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USF2Q15853 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USF2Q15853 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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