Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRRQ15256 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRRQ15256 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
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