Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBX1Q14549 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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