Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2H2Q13888 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2H2Q13888 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H2Q13888 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H2Q13888 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H2Q13888 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H2Q13888 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H2Q13888 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H2Q13888 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H2Q13888 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H2Q13888 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H2Q13888 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H2Q13888 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H2Q13888 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H2Q13888 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H2Q13888 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H2Q13888 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2H2Q13888 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
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