Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CACNA1SQ13698 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CACNA1SQ13698 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CACNA1SQ13698 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CACNA1SQ13698 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CACNA1SQ13698 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CACNA1SQ13698 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CACNA1SQ13698 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CACNA1SQ13698 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CACNA1SQ13698 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CACNA1SQ13698 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CACNA1SQ13698 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CACNA1SQ13698 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CACNA1SQ13698 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CACNA1SQ13698 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CACNA1SQ13698 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CACNA1SQ13698 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CACNA1SQ13698 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CACNA1SQ13698 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CACNA1SQ13698 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CACNA1SQ13698 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CACNA1SQ13698 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CACNA1SQ13698 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CACNA1SQ13698 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CACNA1SQ13698 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CACNA1SQ13698 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CACNA1SQ13698 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CACNA1SQ13698 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CACNA1SQ13698 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CACNA1SQ13698 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CACNA1SQ13698 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CACNA1SQ13698 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CACNA1SQ13698 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CACNA1SQ13698 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CACNA1SQ13698 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CACNA1SQ13698 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CACNA1SQ13698 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CACNA1SQ13698 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CACNA1SQ13698 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CACNA1SQ13698 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CACNA1SQ13698 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CACNA1SQ13698 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CACNA1SQ13698 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CACNA1SQ13698 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CACNA1SQ13698 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CACNA1SQ13698 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CACNA1SQ13698 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CACNA1SQ13698 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CACNA1SQ13698 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNA1SQ13698 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNA1SQ13698 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNA1SQ13698 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNA1SQ13698 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CACNA1SQ13698 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CACNA1SQ13698 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CACNA1SQ13698 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CACNA1SQ13698 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CACNA1SQ13698 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CACNA1SQ13698 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CACNA1SQ13698 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CACNA1SQ13698 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CACNA1SQ13698 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CACNA1SQ13698 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CACNA1SQ13698 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CACNA1SQ13698 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CACNA1SQ13698 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CACNA1SQ13698 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CACNA1SQ13698 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CACNA1SQ13698 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CACNA1SQ13698 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CACNA1SQ13698 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CACNA1SQ13698 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNA1SQ13698 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNA1SQ13698 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNA1SQ13698 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNA1SQ13698 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CACNA1SQ13698 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CACNA1SQ13698 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CACNA1SQ13698 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CACNA1SQ13698 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
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