Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BFSP2Q13515 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BFSP2Q13515 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BFSP2Q13515 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BFSP2Q13515 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BFSP2Q13515 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BFSP2Q13515 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BFSP2Q13515 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BFSP2Q13515 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BFSP2Q13515 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BFSP2Q13515 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BFSP2Q13515 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BFSP2Q13515 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BFSP2Q13515 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BFSP2Q13515 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BFSP2Q13515 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BFSP2Q13515 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BFSP2Q13515 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BFSP2Q13515 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BFSP2Q13515 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BFSP2Q13515 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BFSP2Q13515 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BFSP2Q13515 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BFSP2Q13515 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BFSP2Q13515 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BFSP2Q13515 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BFSP2Q13515 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BFSP2Q13515 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
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