Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XRCC4Q13426 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
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