Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRPL49Q13405 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MRPL49Q13405 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL49Q13405 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
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