Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC15Q0P6D6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC15Q0P6D6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms