Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NIPAL4Q0D2K0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms