Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCBP1Q09161 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCBP1Q09161 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms