Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC14□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRP1Q07954 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LRP1Q07954 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LRP1Q07954 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LRP1Q07954 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRP1Q07954 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRP1Q07954 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms