Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN11Q06124 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPN11Q06124 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN11Q06124 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN11Q06124 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN11Q06124 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN11Q06124 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN11Q06124 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN11Q06124 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN11Q06124 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN11Q06124 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN11Q06124 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN11Q06124 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN11Q06124 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN11Q06124 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN11Q06124 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN11Q06124 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN11Q06124 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN11Q06124 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN11Q06124 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN11Q06124 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN11Q06124 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN11Q06124 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN11Q06124 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN11Q06124 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN11Q06124 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN11Q06124 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms