Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TLE4Q04727 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TLE4Q04727 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TLE4Q04727 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TLE4Q04727 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TLE4Q04727 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TLE4Q04727 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TLE4Q04727 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TLE4Q04727 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TLE4Q04727 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TLE4Q04727 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TLE4Q04727 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TLE4Q04727 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TLE4Q04727 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms