Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
TOP2BQ02880 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
TOP2BQ02880 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
TOP2BQ02880 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
TOP2BQ02880 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
TOP2BQ02880 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
TOP2BQ02880 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
TOP2BQ02880 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
TOP2BQ02880 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
TOP2BQ02880 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
TOP2BQ02880 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
TOP2BQ02880 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC39.63■■■■□ 3.93
TOP2BQ02880 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
TOP2BQ02880 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
TOP2BQ02880 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
TOP2BQ02880 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
TOP2BQ02880 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
TOP2BQ02880 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
TOP2BQ02880 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
TOP2BQ02880 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
TOP2BQ02880 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
TOP2BQ02880 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
TOP2BQ02880 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
TOP2BQ02880 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
TOP2BQ02880 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
TOP2BQ02880 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
TOP2BQ02880 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
TOP2BQ02880 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
TOP2BQ02880 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
TOP2BQ02880 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
TOP2BQ02880 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
TOP2BQ02880 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
TOP2BQ02880 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
TOP2BQ02880 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
TOP2BQ02880 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.93
TOP2BQ02880 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
TOP2BQ02880 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
TOP2BQ02880 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
TOP2BQ02880 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC39.57■■■■□ 3.92
TOP2BQ02880 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.57■■■■□ 3.92
TOP2BQ02880 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
TOP2BQ02880 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
TOP2BQ02880 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
TOP2BQ02880 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
TOP2BQ02880 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
TOP2BQ02880 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
TOP2BQ02880 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
TOP2BQ02880 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
TOP2BQ02880 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC39.53■■■■□ 3.92
TOP2BQ02880 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
TOP2BQ02880 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
TOP2BQ02880 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
TOP2BQ02880 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
TOP2BQ02880 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
TOP2BQ02880 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
TOP2BQ02880 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
TOP2BQ02880 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.92
TOP2BQ02880 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC39.48■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC39.47■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
TOP2BQ02880 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
TOP2BQ02880 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
TOP2BQ02880 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
TOP2BQ02880 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
TOP2BQ02880 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
TOP2BQ02880 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
TOP2BQ02880 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
TOP2BQ02880 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
TOP2BQ02880 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
TOP2BQ02880 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms