Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK6Q00534 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CDK6Q00534 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK6Q00534 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms