Protein–RNA interactions for Protein: P78552

IL13RA1, Interleukin-13 receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL13RA1P78552 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IL13RA1P78552 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IL13RA1P78552 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.3 ms