Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEP78395 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEP78395 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 709.5 ms