Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBB4BP68371 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBB4BP68371 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms